Na Zavodu za elektroničke sustave i obradbu informacija djeluje više znanstveno-istraživačkih laboratorija koji provode istraživanja u raznim područjima elektroničkih sustava i obradbe informacija.

• Laboratorij za naprednu instrumentaciju (AIG)
• Laboratorij za naprednu obradbu signala (ASPL)
• Laboratorij za analognu i miješanu obradbu signala (AMSPL)
• Laboratorij za računalnu biologiju (CBL)
• Laboratorij za elektroničku instrumentaciju i biomedicinsku elektroniku (EBMIG)
• Laboratorij za obradbu i analizu slike (IPG)
• Laboratorij za signale i sustave (LSS)
• Laboratorij za senzore i elektroničku instrumentaciju (SEIG)
• Laboratorij za obradbu signala i dizajn sustava (SPSD)
• Laboratorij za obradbu govora i signala (SSPG)