Na Zavodu za elektroničke sustave i obradbu informacija djeluje više istraživačkih laboratorija:

Laboratorij za analitiku financija i rizika (LAFRA)

Laboratorij za bioinformatiku i računalnu biologiju (LBCB)

Laboratorij za naprednu 3D rekonstrukciju i registraciju površina (SHARK Lab)

Laboratorij za obradu slike (LOS)

Laboratorij za inteligentne senzorske sustave (LISS)

Laboratorij za naprednu obradbu signala (ASPL)

Laboratorij za signale i sustave (LSS)

Laboratorij za biomedicinsku elektroniku (LBE)
 

Istraživači Zavoda vode ili sudjeluju u radu sljedećih istraživačkih centara Fakulteta elektrotehnike i računarstva:

Centar za umjetnu inteligenciju

Znanstveni centar izvrsnosti za znanost o podatcima i kooperativne sustave

Istraživački centar izvrsnosti za napredne kooperativne sustave

Centar izvrsnosti za računalni vid